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O que já fizemos sobre o COVID-19

1. A 17 de Fevereiro, saiu um artigo da CDC China com os dados sobre o CFR (case fatality rate) devido ao COVID-19 para diferentes condições. Tivemos conhecimento deste artigo a 20 de Fevereiro. A 24 submetemos um trabalho sobre o risco associado aos factores descritos que se encontra online desde então.
As principais conclusões a que chegámos foram:

  • A idade é o maior factor de risco associado à morte. Principalmente a partir dos 50 anos sendo este risco, em média, 6 vezes maior a partir desta idade, 18 vezes maior a partir dos 60 anos, 43 vezes maior a partir do 70 anos e 86 vezes maior a partir do 80 anos. 
  • A presença de comorbilidades como diabetes, hipertensão, doença cardio-vascular, cancro ou doença respiratória aumenta grandemente o risco de mortalidade, sendo a doença cardio-vascular aquele que tem um maior peso, com um risco de 13 vezes.
  • O sexo masculino tem maior risco de morte, 1.8.
  • Apresentámos uma equação que permite calcular a probabilidade de morte para factores de risco combinados.



2. Quando se começaram a registar casos de COVID-19 noutros países, uma das questões que se colocou foi sobre o efeito de variáveis metereológicas na epidemia. Abordámos este assunto no trabalho submetido a 5 de Março.
As principais conclusões a que chegámos foram:

  • A temperatura e a humidade afectam o tempo de duplicação da epidemia de COVID-19, mas outras variáveis metereológicas não.
  • O aumento de temperatura faz aumentar o tempo de duplicação, ou seja, diminui a velocidade de propagação do SARS-CoV-2
  • O aumento de humidade faz diminuir o tempo de duplicação, ou seja, aumenta a velocidade de propagação
  • Apesar desta relação, a velocidade de propagação varia pouco com a temperatura e com a humidade. Por exemplo, um aumento de 20 ºC faz aumentar o tempo de duplicação em aproximadamente de 1.8 dias.

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Covid-19 na Europa, dados semanais (6/3/2022)

  (Clicar numa imagem e usar as teclas das setas para mudar de imagem) Fonte: ECDC - European Centre for Disease Prevention and Control ( https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/country-overviews ) Incidência (novos casos por 100 mil habitantes acumulados em 14 dias) na União Europeia: Variação de incidência: Evolução em alguns países da Europa (regiões NUTS) Gráficos mais vermelhos (mais azuis) significam que tiveram um maior (menor) aumento na última semana.  Portugal Espanha França Alemanha Irlanda Croácia Rep. Checa Holanda Austria Roménia Suécia Noruega Dinamarca Polónia Hungria Finlândia

Situação COVID-19: Portugal na Europa, dados diários (30/10/2020)

  Fonte: ECDC - European Centre for Disease Prevention and Control ( daily_subnational_14-day_notification_rate  e  situation update for the EU/EEA and the UK ) Evolução dos novos casos por 100000 habitantes acumulados em 14 dias na União Europeia: Evolução em alguns países da Europa (regiões NUTS) Gráficos mais recentes: dados do ECDC até  9/9/2020  inclusive. Gráficos mais vermelhos (mais azuis) significam que tiveram um maior (menor) aumento na última semana.  Os dados diários relativos a Portugal (pelo menos) têm atraso relativamente aos  dados semanais  e relativamente à data actual. Passa-se um período grande de tempo desde o momento da infecção ao aparecimento do caso nas estatísticas. É necessário conhecer alguns desses tempos para se interpretar correctamente os gráficos. Informação do ECDC  aqui . É também necessário perceber os níveis de testagem e taxas de positividade dos testes, etc para se interpretar melhor os gráficos. Informação do ECDC  aqui  para cada país. Portugal

Sobre o alisamento das curvas com média móvel de 7 dias

Várias curvas apresentadas neste blogue foram alisadas utilizando uma média móvel de 7 dias, como no exemplo da figura abaixo. O que quer isso dizer, porque se faz isso e quais os seus efeitos? Utilizou-se alisamento para facilitar a leitura das curvas: elas assim aparecem com menos flutuações, permitindo ver melhor a tendência principal. Alisar com média móvel de 7 dias significa que cada ponto da curva original é subtituído pela média dos 7 pontos mais próximos. Cada ponto da curva representa um dia, pelo que o valor de um ponto na curva alisada é a soma dos valores dos 3 dias anteriores, dos 3 dias posteriores e do próprio dia da curva original, a dividir por 7. Esta média é feita para todos os pontos da curva (média móvel). Assim, as flutuações semanais, que são as mais frequentes neste tipo de dados reduzem-se bastante. Por exemplo, é natural que se processem menos amostras aos fins-de-semana, resultando numa periodicidade de 7 dias nos casos confirmados: Há contudo um efeito que